1. При устоновке VS.NET на С: \ пишеться папка InetPub.
2. И в папку Програмные Файлы (Program Files) он устанавливается в разных папках
Вопрос :
Это так и должно быть и что это за папки

InetPub - это каталог данных для IIS
Остальные - приложения .net